Le nom « Asselin » est en fait celui de l'un des fondateurs du Collège de Jonquière, le père Pierre-Paul Asselin. Originaire de la région, Pierre-Paul Asselin a fait ses études à Ottawa et est devenu prêtre chez les Oblats de Marie Immaculée en 1937. En 1955, le père Asselin est revenu dans la région pour fonder le Collège de Jonquière et il en a été le recteur pendant 12 ans.
Avec la grande réforme en éducation de 1967, le Collège de Jonquière est devenu le Cégep de Jonquière, et son premier directeur général fut le père Asselin, qui a travaillé au développement du Cégep de Jonquière jusqu'en 1979. C'est donc afin de lui rendre hommage qu'on a donné son nom à la Fondation. Le Père Asselin a marqué le milieu de l'éducation au Saguenay-Lac-Saint-Jean pendant près de 25 ans, ce qui lui a d'ailleurs valu un doctorat honorifique de l'Université du Québec à Chicoutimi.
En raison de sa nouvelle relation de partenariat avec le Cégep, la Fondation Asselin du Cégep de Jonquière inc. a dû redéfinir son rôle et se positionner dans le milieu régional de l'éducation. C'est par le biais du Fonds Pierre-Paul Asselin, notamment, que la Fondation assume une des dimensions de sa mission en se préoccupant d'économie sociale, d'engagement envers la communauté et d'éducation populaire. Le fonds soutient des projets éducatifs structurants pour le milieu.